La Déclaration de Berne est une association suisse composée de trois sections. Les décisions opérationnelles de la section romande sont prises de manière collégiale par les membres du secrétariat. Un membre de l’équipe est chargé de la coordination des activités du secrétariat. Une direction collégiale composée de trois collaborateurs est responsable des décisions opérationnelles du secrétariat alémanique. Les décisions stratégiques sont prises par les trois comités régionaux, qui fonctionnent en tant qu’organes de direction.

Le secrétariat de Lausanne emploie 6 collaborateurs et celui de Zurich 17 collaborateurs. Il n'y a pas de secrétariat pour le Tessin, mais le comité régional pour la Suisse italienne réalise des campagnes bénévolement. Le suivi des contacts avec les membres tessinois est réparti entre le secrétariat romand et alémanique.

La Déclaration de Berne est financée par les contributions de ses membres et la vente de ses publications, ce qui lui assure une totale indépendance. Elle édite la revue Vers un développement Solidaire.